Для начала Вам необходимо скачать модуль соответствующий Вашей операционной системе. Ссылки для скачивания Вы можете найти на официальном сайте ionCube.
Скачиваем архив с сайта разработчика командой:
wget http://downloads2.ioncube.com/loader_downloads/ioncube_loaders_lin_x86-64.tar.gz
Распакуем наш архив командой:
tar -xvf ioncube_loaders_lin_x86-64.tar.gz
Нам необходимы файлы те, что соответствуют версии PHP на сервере. Проверяем установленную версию PHP:
php -v
Создадим отдельную директорию на модуля ionCube командой:
mkdir /usr/lib/php5/modules
В зависимости от версии PHP копируем нужные файлы из распакованной папки в только что созданную директорию:
cp ioncube/ioncube_loader_lin_5.4.so /usr/lib/php5/modules/
cp ioncube/ioncube_loader_lin_5.4_ts.so /usr/lib/php5/modules/
Теперь создадим дополнительный конфигурационный файл ioncube.ini с указанием путей до файлов модуля:
nano /etc/php5/conf.d/ioncube.ini
Прописиваем наши пути:
zend_extension = /usr/lib/php5/modules/ioncube_loader_lin_5.4.so
zend_extension_ts = /usr/lib/php5/modules/ioncube_loader_lin_5.4_ts.so
php -m